1、树种不同，扁桃和蟠桃虽然都是蔷薇科桃属植物，但却是完全不同的两个树种，扁桃是一个干果树种，也是木本油料树种之一，而蟠桃是普通桃树的一个变种，是一个水果树种。 2、食用部分不同，扁桃是以核仁为食用部分，其核仁香脆可口，营养丰富，扁桃的外果皮纤维多，汁液少，多不可食用，而蟠桃是以果肉为食用部分，果肉香甜多汁，味浓香溢，核仁多发苦，不可食用，多作为中药配料进行使用。
