蛋白质的的水解产物是氨基酸。但彻底水解往往需要一个过程，也就是长链的蛋白质（比如说由1000个氨基酸水解而成）先要在蛋白酶的催化下水解成为较短链的多肽（比如说由10个氨基酸水解而成），最后再在肽酶的催化作用下彻底水解为氨基酸。
蛋白质的水解产物为多肽（即几个氨基酸缩合的产物）和氨基酸淀粉水解的产物有糊精、低聚糖、葡萄糖、果糖等。要看反应条件的，反应条件不同，那么产物就有所差异，通常是上述物质的组合。
分类
根据水解程度，蛋白质水解可以分为完全水解：彻底水解得到的水解产物为各种氨基酸的混合物和部分水解：不完全水解得到的水解产物是各种大小不等的肽段和单个氨基酸。
蛋白酶按水解底物的部位可分为内肽酶以及外肽酶，前者水解蛋白质中间部分的肽键，后者则自蛋白质的氨基或羧基末端逐步降解氨基酸残基。
蛋白水解方式主要有化学水解和酶水解。化学水解是利用强酸强碱水解蛋白，虽然简单价廉，但由于反应条件剧烈，生产过程中氨基酸受损严重，L-氨基酸易转化成D-氨基酸，形成氯丙醇等有毒物质，且难以按规定的水解程度控制水解过程，故较少采用而生物酶水解是在较温和的条件下进行的，能在一定条件下定位水解分裂蛋白质产生特定的肽，且易于控制水解进程，能够较好的满足肽生产的需要。
作用
蛋白质水解对人体吸收有利，通过蛋白质水解，水解为二肽或三肽的产物在人体内要比自由氨基酸和没有水解的蛋白质更易于吸收。
