两者之间的区别在于两者的概念不同，概念包含的含义也不相同。
安全事故是由于在操作生产经营活动行为中，违反了有关规定和标准，造成了不同程度人身受到伤害和财产受到损失的事实，是违章造成的结果。而违章是指违反有关法规章程制度的行为。违章是行为，安全事故是违章造成的结果。
安全事故是已经发生了事故，而违章不一定会发生安全事故违章只是有危害秩序和安全的可能性，安全事故则是违反安全管理法规已经造成了人身伤亡和财产损失后果违章只涉及对违章人员的处罚问题，安全事故涉及对肇事者的处罚和损害赔偿问题。
安全事故是一种结果，违章则是一种行为。安全事故一般都是由违章造成的。但不是所有的违章都能造成安全事故。这就是必然和偶然的区别。
