1、等級不同：博物院的規模更大，屬國家級博物館則多是市級。
2、藏品數量不同：博物院的藏品會比博物館更多，且更珍貴。
3、性質不同：博物館的職能相對比較單一，主要就是收藏與展出。而博物院除了基本的職能外，往往還常設有專門的文物研究、鑑定研究機構，有專職的研究員團隊。
4、建築文化不同：許多博物院的建築本身就是“文物”，即使不是老建築，也是值得欣賞的藝術品。所以博物院本身建築的文化價值、藝術價值較博物館更高。
博物院和博物館的區別是等級規模和藏品不同的區別。博物院等級規模屬於國家級，博物館等級規模屬於省市級。博物院藏品巨大，種類多，很多稀世珍品。博物館的藏品很少，無法與博物院相比。
1、除我國外，其它國家名稱及其譯名沒有“博物院”的概念。如西方媒體評選的世界四大博物館名稱及中文通行譯名：法國巴黎盧浮宮（法國國家博物館）、英國倫敦大英博物館、美國紐約大都會博物館和俄羅斯聖彼得堡冬宮/國立艾爾米塔什博物館。
2、我國《文物保護法》和《博物館管理條例》只有“博物館”和“館藏文物”的提法。我國對博物館機構的管理區分，只有性質（國有/非國有博物館）、分類（綜合類、歷史類、藝術類、科學與技術類）和分級（一二三級）等，而沒有區分博物館和博物院的不同。
3、我國目前稱之爲“博物院”，且劃爲國有的一級的博物館機構有10多家。
