1、在使用儀器之前，首先將記錄儀(色譜工作站)、自動部分收集器、恆流泵以及層析柱等所需配套儀器連線好，接好各類插頭與插座(220V電源)。
2、將檢測儀電源開關ON按下，如果電源指示燈亮了，那麼表示儀器電源開始工作了，之後對光源指示燈進行觀察，如果光源指示燈亮了，那麼說明光源已經開始工作，儀器能夠進入到工作狀態，旋轉檢測儀波長旋鈕旋到所需波長刻度位置，撥量程旋鈕到1%檔（先將儀器預熱20min，然後等到基線平直以後就能夠進行加樣測試）。
3、將記錄儀電源開關接通，撥動電源開關使指示燈亮。紙速度能夠通過記錄儀說明書進行調節，使用者按照需求自行掌握，用10mV檔進行測量。這時，記錄儀指標由零點開始向右移動某一刻度，對檢測儀光量”旋鈕進行調節，使指標在記錄儀大約中間位置5mV左右數字停留。
4、在恆流泵上接上檢測儀進樣口聚乙烯塑料，在檢測儀流過凝膠層析柱中緩衝液（1-3ml/min為恆流泵流量視凝膠層析柱大小），將吸光度A值使用調零調整為0
5、完成上述步驟之後，析系統平衡之後就能夠開始使用洗脫液對樣品進行洗脫，再一次調吸光度0點在洗脫前。不能夠再在洗脫過程完成之前對0旋鈕進行調節。當洗脫液從檢測儀流過的時候，大於零的數值為吸光度顯示，隨著樣品的濃度的變化，吸光度數值大小也會發生改變。結束洗脫後，稍大於零的數值為吸光度顯示。
6、記錄儀自動繪製吸光度圖譜以及數字顯示吸光度這兩個檢測系統之間是互相獨立的。蛋白檢測儀器所繪峰值大小與數字顯示吸光度不能夠互相換算，沒有直接的關係。
7、結束測試之後，必須將電源切斷，並且將聚乙烯塑料管和樣品池用蒸餾水進行清洗。
