玉龙雪山石头地层属滇藏地层区，主要是中泥盆纪至中石炭纪的碳酸盐岩，其次是二迭纪的石头夹灰岩，三迭纪灰岩夹砂页岩。
玉龙雪山石头是由火山喷发出的岩浆冷却后凝固而成的一种致密状或泡沫状结构的石头。它在地质学的岩石分类中，属于岩浆石头（也叫火成石头）。岩浆岩分侵入岩和喷出岩两种。其中侵入岩是地下岩浆在内力作用下侵入地壳上部，岩层冷却凝固而形成石头，它的矿物结晶颗粒较大，代表石头有花岗石。喷出岩是地下岩浆在内力作用下，沿地壳薄弱地带喷出地表冷凝而形成石头，它的矿物结晶颗粒细小，有的有流纹或气孔构造，代表石头就是玉龙雪山石头。
