1、蛋的選擇：番鴨蛋種蛋選自健康7月齡-1歲種鴨，一般選擇玉白色、潔淨、無裂縫、無沙殼、無鋼殼、無異物、不散黃、非雙黃蛋，單重大小為75-85克，蛋形指數1.37-1.42的，經過消毒後放在11-15度的環境彙總保存一週。
2、孵化期温度、濕度及孵化機內氧氣和二氧化碳含量：鴨的孵化期為35天，孵化温度分恆温孵化：胚齡1-32天和33-35天，機內温度分別為37.5都和37-36.5度變温孵化：胚齡1-6天、7-24天、25-35天，機內温度分別為38.2-38度、37.8-37.4度和37-36.5度。孵化濕度為：初期60-65%，中期為55-60%，後期為75-80%。空氣：孵化機內氧氣21%，二氧化碳含量0.5%。
3、翻蛋：採用平面孵化器或桶孵化法，每天晚上翻蛋次數不少於6次。使用電孵化機翻蛋每晝夜不少於8-12次，結合胚蛋噴水涼蛋是，可以將番鴨蛋翻轉180度。
4、涼蛋：孵化到14天后，蛋温已達到38度，因此每天要定時對胚蛋進行噴水涼蛋，等到25天后要增加噴水涼蛋的次數和時間，噴水温度為25-28度。
5、照蛋：5-7天頭照，蛋“起珠”，15-16天二照蛋“合攏”，30-32天三照，蛋“閃毛”，主要是為了淘汰無精蛋、死胚蛋
6、啄殼：主要是對出雛和雛雞進行觀察，從出雛到出齊為30個小時
