行程卡和健康碼的區別有來源不同、對象不同、用途不同、定義不同和功能不同。
1、來源不同
行程碼：行程碼由工信部組織中國信通院、三家基礎電信企業面向公眾推出。健康碼：健康碼由各省份聯合所屬市區面向公眾推出。
2、對象不同
行程碼：行程碼面向復工復產返程人員。健康碼：健康碼面向市區居住人員。
3、用途不同
行程碼：行程碼用於查詢14天內國內城市（駐留超過4小時）以及境外到訪的行程。健康碼：健康碼除了用於報備個人健康外，主要是掌握行動軌跡，比如，進商場超市、坐公交、地鐵等。
定義不同
健康碼是COVID-19防控疫情的個人健康信息和活動信息的跟蹤和判斷系統。基於真實數據，市民或復工人員可自行在線申報，經後台審核後，可生成個人二維碼。
行程碼服務是由工業和信息化部中國信息通信研究院聯合中國電信、中國移動、中國聯通共同推出。通過利用三大運營商的通信大數據，為全國16億手機用户提供出行查詢，已在全國多個省份廣泛使用。
5、功能不同
“健康碼”管理信息系統以真實數據為基礎，與重點人員動態管控名單等相關數據庫對接，根據羣眾申報信息和背景數據的核查比對結果，發放“健康碼”。背景數據實時更新，是一個動態監測過程。根據個人健康信息和環境暴露歷史的變化，顏色會發生變化。通過健康碼，實現了一碼就醫、預約掛號、一鍵急救、心理援助、健康證明、健康檔案等多項健康應用。
國家綜合政務服務平台將通信大數據出行卡的信息納入“防疫健康信息碼”服務。在“旅行卡”數據顯示的14天境內外旅遊申報和查詢中，申報本人近14天內去過的境外國家（地區）和國內城市後，系統將對申報信息和旅行卡數據進行核實，避免虛報、假報。
健康碼和行程卡的區別主要有以下幾點：1、健康碼是一種公共衞生信息的數字編碼，是一種用於標識和核實公眾健康信息的數字編碼，用於公共衞生管理及做好防控工作。2、行程卡是由國家衞生健康委員會（NHFPC）提出的，是一種健康保障性憑證，用於將個人健康狀況和旅行信息連接起來，以方便實現應急管理、疫情監測和阻斷病毒傳播的措施。3、健康碼和行程卡的信息元素不同，健康碼的內容主要包括公共衞生信息，如體温、身份證、體質等，而行程卡的內容主要包括旅行路線、行車時間等。
