雲南交通中心醫院又名雲南中醫藥大學第二附屬醫院，始建於1970年9月。位於昆明市官渡區東郊路菊華立交橋旁邊。2018年6月醫院類別由“綜合醫院”變更為三級乙等中西醫結合醫院。2020年7月，實施了與學校鍼灸推拿康復學院“院院合一”的改革，形成雲南中醫藥大學第二臨牀醫學院、鍼灸推拿康復學院、第二附屬醫院和雲南省血栓病醫院“四塊牌子一套班子”的管理體制和運行機制。
經過50年的建設，醫院已發展成為一所以血栓病防治、鍼灸推拿、康復治療為特色的集臨牀、教學、科研為一體的大學附屬醫院。現有編制牀位455張，在職職工496人。
醫院建有120急救站，加入全市急診醫療網，承擔突發公共衞生事件和災害事故的緊急救援任務，是雲南省區域中醫（腦病）診療中心，雲南省“卒中中心”。血栓科為省級重點專科，腦血管病為醫院重點診療項目。
