丹蔘的收穫可分不同時期進行。分根繁殖、蘆頭繁殖和扦插繁殖的，可於栽培後當年11月或第二年春季萌發前採挖。種子繁殖的，於移栽後第二年的10～11月或第三年早春萌發前採挖。
由於丹蔘根質脆、易斷，故應在晴天、土壤半乾 半濕時挖取，挖後可在田間曝曬，去掉泥土，運回進行加工，切忌用水洗根。
秋季收穫時選擇直徑0.7～1釐米、顏色紫紅、無病蟲害、發育充實的當年生丹蔘根作種根，濕沙藏至翌春。早春3～4月，將種根切成4～6釐米小段，按行距株距深度35釐米×25釐米×6釐米的規格，將切好的種根豎着放入穴中，一穴一段，大頭朝上，切勿顛倒，覆土2釐米左右，不宜過厚，否則影響出苗。每畝用種根50公斤左右。用根段種植，開花晚，當年難收到種子，但根部生長較快，藥材產量高。
