由于咖啡豆是由细小的纤维细胞组织所构成，所以在咖啡豆研磨的过程中，其纤维细胞会被切开，咖啡油和香醇的味道同时被释放出来。因此想要冲泡一杯香醇可口的咖啡，研磨过程是非常重要的。市场上现有很多种咖啡豆的研磨机，它们基本上可以被分成两类：一类用刀片，比较便宜，但要注意选择摩擦热较低的材质及构造，研磨时，需要多开关几次，并且注意抖动均匀，不然咖啡会发出焦味，而且还可能会产生其他怪味。另外一种则用磨石，相对比较贵，但能研磨得更均匀， 在研磨时，宜轻轻转动，以避免产生磨擦热。在研磨的过程中，要注意的是，研磨出来的颗粒粗细应一致，如此才能在冲泡时，使每一粒咖啡粉末均匀地释放成分，达到咖啡浓度均匀的效果。至于粗细程度，主要取决于冲泡方法和冲泡时间。基本上，冲泡时间愈短，研磨的颗粒宜愈细致。因为颗粒愈小，和热水接触的面积愈大，故冲泡的时间要愈短。
