二者的主要区别是：第一、 北京同仁堂和同仁堂牌的指向含义不一样：其中北京同仁堂是指北京同仁堂集团而同仁堂牌是指北京同仁堂集团下的包括药品、医院制剂、保健食品、食品、化妆品等在内的品牌系列名称。第二、 北京同仁堂和同仁堂牌的创立日期不一样：其中北京同仁堂创立于1669年而第一个同仁堂牌的产品是2017年7月推出的。
