原因很多。
首先是愚忠思想，饱读经书，愿意为理想献身。
第二是感恩朱元璋几代人的知遇之恩。他父亲犯过事，没人敢推举他，35岁还一事无成。
朱元璋偶然一次看见了他的文章，很欣赏他，就召他入宫准备辅助太子朱标。
朱标早亡，朱元璋授予方孝孺教授一职，让他给儒生讲课，辅佐皇长孙朱允炆。
建文帝登基后，招方孝孺到宫中，让他批改文书。处理政事时，都会询问他的意见。
三是为建文帝的死负责。
朱棣起兵造反，是方孝孺给建文帝出的主意造成的。有人劝朱允炆迁都，方孝孺去各地征召援军，让建文帝死守待援，君王死社稷。建文帝的死，方孝孺负有重大责任。朱棣如他所愿，灭了他十族共873人。
