答:水田建房办理农用地转用审批手续才合法。
如果该水田列入基本农田保护范围，需要建房的，必须逐级审批，最后经国务院批准后才能建房。
如果没有列入基本农田保护范围的水田，经村民小组、村民委员会、当地乡政府批准后，报国土资源局对其进行审批即可。
根据相关条文规定，建设占用土地，涉及农用地转为建设用地的，应当办理农用地转用审批手续。
一是如果该水田列入基本农田保护区范围的，需要建房的，必须逐级审批，最后报国务院批准后才能建房。二是没有列出基本农田保护区范围内的水田，经村民小组、村民委员会、当地乡镇政府批准后，报县国土资源局对其进行审批即可。不然就成违建了
