好氧发酵好氧发酵是指好氧微生物在与空气（氧气）接触的条件下生长、繁殖，氧化有机物或无 机物的产能代谢过程。专性好氧微生物把氧作为最终电子受体，通过有氧呼吸获取能量。向微生物提供充足的氧气，在发酵过程中需提供大量新鲜空气并搅拌。
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厌氧发酵厌氧发酵（又称嫌气发酵，anaerobic fermentation）是指在隔绝空气的条件下，兼性微生物和专性厌氧微生物生长并进行生物化学作用，对物质进行生化降解的过程。例如，梭状芽孢杆菌引起的丙酮、丁醇发酵，沼气发酵等。对于专性厌氧微生物，氧对其有毒性作用。
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兼性厌氧发酵兼性厌氧发酵是利用兼性厌氧微生物进行的发酵。兼性厌氧微生物是指既可在有氧环境，又可在无氧环境中生活的微生物。
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液态发酵（liquid fermentation）是最常见的发酵方式，又分为深层发酵
