两者培养目标不同。
林学主要培养具有良好道德修养和生态文明意识，具备扎实的专业基础理论，掌握林学、生物学、植物保护学、生态学的研究方法，能够在林木遗传育种、森林培育、森林资源经营管理、森林病虫害防治、森林资源保 护以及生态环境建设与保护等领域从事生产应用、林业管理和科学研究的研究型人才。
林业工程主要培养具有良好的国际视野，能够积极践行和弘扬社会主义核心价值观，富有爱国精神和时代精神，能适应林业工程相关领域需求的人才。在培养过程中，分为木材科学与工程、林产化工两个专业方向。毕业生能够在木材科学与工程、林产化工、生物质复合材料、生物质资源与转化、家具制造、林产品经营与贸易等领域从事科学研究、技术开发、工程设计、产品生产、教学、经营管理、国际贸易等方面的创新型科学研究人才或工程技术人才。
林学和林业工程区别
林学是一门既传统，又现代的学科。说它传统是在于它对森林，木材，相关的环境，以及动植物资源的认知广度和深度
说它现代，是因为它将树木遗传工程、自动控制和液压技术等尖端科技运用于实际的林间操作与研究。既有生物科学研究，又涉及工业技术科学。
简单来说，林学是一门研究如何认识森林、培育森林、经营森林、保护森林和合理利用森林的学科，是在其他自然学科发展的基础上，形成和发展起来的综合性的应用学科。
林业工程类专业下设森林工程、木材科学与工程、林产化工三个专业，涵盖从林木开采到物理加工、化学加工的各个方面。
林学是指关于林业的一门学科，林业工程是林学中关于林业发展的一个学科类别，林学（Forestry）是研究森林的形成、发展、管理以及资源再生和保护利用的理论与技术的科学，属于自然科学范畴。林学是一门研究如何认识森林、培育森林、经营森林、保护森林和合理利用森林的学科，它是在其他自然学科发展的基础上，形成和发展起来的综合性的应用学科。
