文豪野犬（动漫）的三大组织分别是“武装侦探社”“港口黑手党”“组合”等等。
1、武装侦探社
最初时期，夏目漱石为侦探社获得异能开业许可证做出了巨大贡献。侦探社是为了处理警察处理不了的危险事务而成立的。被称为生存于白昼世界与黑夜世界的夹缝之中，黄昏的武装集团，其成员大部分是拥有异能力的能力者。
2、港口黑手党
以港口为势力范围的凶恶组织，是比黑社会的暗部更加阴暗危险的群体。已知内部成员级别森严，有专门关押犯人的地牢，对待叛徒有独特的处理方式。最高决策机构为“五大干部会议”，会议数年召开一次，负责决定组织内部的重大事项。
3、组合
北美的能力者集团，都市传说般的存在，其成员表面上都是财政界与军事要员，私下则拥有庞大资金且身负异能，是个策划了众多阴谋的秘密组织。
文豪野犬的三大组织是横滨三方首领，分别是港口黑手党森欧外，武装侦探社福泽瑜吉，异能特务科种田长官。这三个组织很厉害。
