亚甲基蓝在治疗非后期鱼病比较有效，可以用于水霉、烂尾，车轮虫、小瓜虫、口丝虫、斜管虫性疾病，跟三代虫、指环虫、以及皮肤和鳃部的寄生虫。
使用浓度为10毫克/升的亚甲基蓝溶液，每次浸泡鱼体10-20分钟，可以防治水霉病，跟盐配合，效果有保障。
2-3毫克/升的浓度，每个两三天使用一次，连续使用3-4天，对烂尾有较好的治疗作用。
1、使用10mg/L亚甲基蓝水溶液浸洗10-20分钟左右，可以预防水霉病。
2、在池水中添加亚甲基蓝，让药物浓度达到2-3mg/L，隔天后再次使用一次，一共使用2次，可以有效治疗水霉病以及河蟹链壶菌病。
3、在池水中添加呋喃哒嗪（5mg/L）和亚甲基蓝（1mg/L），可以治疗鲤鱼水霉病。
4、使用2-3mg/L亚甲基蓝水溶液，每2-3天使用一次，连续使用3-4天，可以治疗无鳞鱼水霉病和烂尾病。
5、亚甲基蓝（2mg/L）和食盐（10mg/L）混合使用，可以有效治疗倒刺鲃的水霉病。
