三清山旅游最佳时间是每年的4、5、9、10月。此时，三清山的自然风光最美，此间气温在摄氏20度上下，在三清山海拔1600米以上的山上气温较山下低3-5度。
另外建议别在雨天去爬山，一则路滑，二则山顶会有大雾，什么也看不见，也不要在天气炎热的时候去爬山，一则体力消耗太大。
三清山风景区每年以春节、劳动节、暑假、国庆节为旅游旺季，一旦旺季到来，所有吃、住、行价格会上涨50％到100％左右，而且很有可能找不到住的地方，建议大家尽量避开这些时候去。
一、杜鹃季（5月底-6 月初）
满山遍野的花海，女神峰至玉台一带、风门至玉京峰一带以及流霞台至西海岸一带均有大片杜鹃林，还能看到的漂亮的云海、晚霞和日出
二、秋季中旬（10 月中旬）
每到10月中旬，三清山五彩斑斓，层林尽染，三清山南清园、西海岸、阳光海岸、三清福地等植被丰富，都是观赏秋色的最佳去处。此时也是观日出，赏云雾奇景的好时候，而少见的佛光也会时时出现。
三、冬季（12 月-2 月）
冬季的三清山冰清玉洁，日照云海，冰挂雪景，很是震撼。
一年来一次三清山看到的美景是不全面的，据说三进三清才能看明白这座山。
