通过扣缴义务人申报和综合所得年度自行申报区别区别在于：通过扣缴义务人申报的，意味着通过公司来代扣，适合上班族，选择这项后单位会获得你的申报信息，帮你申报帮你代扣，年终不需要再进行核算和申报，对于上班族来说比较省事。
综合所得指的是工资薪金所得、劳务费收入所得、稿酬所得、特许权使用费所得四项收入合一的综合收入，这种方式预扣预缴的税率非常高。
扣缴义务人申报和综合所得年度自行申报区别如下：
1、通过扣缴义务人申报，是由扣缴义务人（任职单位）按月帮你预扣预缴，如果纳税人申请了子女教育专项附加扣除，任职单位每个月给纳税人发放工资时候，会对子女教育专项附加扣除进行预扣，当月就能享受到减税福利
2、综合所得年度自行申报，是由纳税人在每个纳税年度结束后自行进行申报办理，在下一年享受税收优惠。
《中华人民共和国个人所得税法》
第十一条
居民个人取得综合所得，按年计算个人所得税有扣缴义务人的，由扣缴义务人按月或者按次预扣预缴税款需要办理汇算清缴的，应当在取得所得的次年三月一日至六月三十日内办理汇算清缴。预扣预缴办法由国务院税务主管部门制定。
居民个人向扣缴义务人提供专项附加扣除信息的，扣缴义务人按月预扣预缴税款时应当按照规定予以扣除，不得拒绝。
非居民个人取得工资、薪金所得，劳务报酬所得，稿酬所得和特许权使用费所得，有扣缴义务人的，由扣缴义务人按月或者按次代扣代缴税款，不办理汇算清缴。
