区别如下:
1、主体不同。前者的所有权主体是全体人民，而后者是具有法人资格的集体组织。前者的权利行使有国家代表，后者则是以自然人为代表。
2、所有权的客体不同，前者比后者广泛。在全民所有制中，国家的任何财产都是所有权的客体，不受任何限制。而在自然人所有制中，水流、地下的矿产资源不属于所有权的客体。国家可以依法对于自然人占有有的国家资源，进行征用。
3、权利取得不同。全民所有制中国家代表全民行使权利有宪法规定，而自然人对于集体财产部分的占有、处分、使用、收益和处分的权利是国家授予，在授予的权利的范围内行使权利。
