鄱阳湖已知鸟类310种，其中典型的湿地鸟类(水鸟)159种。按居留型分，留鸟45种，冬候鸟155种，夏候鸟107种，迷鸟3种。有13种为世界濒危鸟类。属国家保护动物的有54种，其中I级保护动物10种：白鹤、白头鹤、大鸨、东方白鹳、黑鹳、中华秋沙鸭、白肩雕、金雕、白尾海雕和遗雕II级保护动物44种，如小天鹅、卷羽鹈鹕、白枕鹤、灰鹤、沙丘鹤、白额雁、白琵鹭等。属于中日候鸟保护协定的保护鸟类有153种，占协定保护鸟类种数227种的67.4%属中澳候鸟保护协定的保护鸟类有46种，占协定保护鸟类种数的56.8%。
