TAE是使用最广泛的缓冲系统。其特点是超螺旋在其中电泳时更符合实际相对分子质量（TBE中电泳时测出的相对分子质量会大于实际分子质量），且双链线状DNA在其中的迁移率较其他两种缓冲液快约10%，电泳大于13kb的片段时用TAE缓冲液将取得更好的分离效果，此外，回收DNA片段时也易用TAE缓冲系统进行电泳。TAE的缺点是缓冲容量小，长时间电泳（如过夜）不可选用，除非有循环装置使两极的缓冲液得到交换。50×TAE Buffer 配制方法： 1。称量Tris 242g，Na2EDTA.2H2O 37.2g 于1L烧杯中 2。向烧杯中加入约800ml去离子水，充分搅拌均匀 3。加入57.1ml的冰乙酸，充分溶解 4。用NaOH调pH至8.3，加去离子水定容至1L后，室温保存。 10×TBE缓冲液（1 mol/L Tris， 0.83mol/L 硼酸，10mmol/L EDTA)： 121.1g Tris，51.35g硼酸，3.72g Na2 EDTA ·2H2O，溶于双蒸水中定容至1升，置于4℃下可贮存2周，其pH约为8.3。
