第一，以西学作为参照，包括亚里士多德和斯宾诺莎的实体学说，乃至黑格尔的“绝对精神”，都有作为外缘的、离开主体客观独存的实体，或超越于主体和客体的“第一因”“主宰者”，君临万物之上的造物主、上帝。儒学本体论则相反，即反对“把本体当作是离我的心而外在的物事”，反对“凭理智作用”，向外界去寻求或建立本体。这就是万物本原与吾人真性的“不二”说。他强调天道人道融合为一，循着思孟和陆王心学的“尽心则知性、知天”的路线，将宇宙本体（或实体）内化为心性本体，并对“天人合一”“孔颜乐处”“浑然与天地万物同体”的人生境界作了本体论（即道德形上学）的论证。
第二，以佛学作参照，熊十力高扬了《周易》形上学的生生不息、尊生健动的学说。先生之本体学说，不仅重立心性之本体，尤其重开本心之大用。根据他的“体用不二”“即体即用”的学说，由即流行即主宰的本体开出了“翕辟成变”的宇宙论，积极入世、自强不息的人生论。生命本体或心性本体是活泼的有内在动力的本体，其变动不居、流行不息的特征及能动性，决非静止的、“耽空滞寂”的自然本体或绝对精神所可比拟，同时又不是柏格森的生命冲动所能取代的。
